בחורפים 2003 ו-2013 היינו עדים להצפות רחבות היקף בשטחים חקלאיים בעמק החולה ואף בסכנה להצפת אזור המגורים ביישובים יסוד המעלה וחולתה. רשות ניקוז כינרת בשיתוף פעולה עם משרד החקלאות, מבצעים תכנית ניקוז שתיתן מענה מהיר לניקוז השטחים המוצפים לאחר סיום האירוע. בשנת 2020 הקמנו עוד כ-12 מתקני "קלאפות" (שסתומים אל-חוזרים) למזעור נזקי השיטפונות וההצפות במרחב ע"ג התעלות מערבית ומזרחית שבעמק החולה.
